میکروارگانیسم‌ها (به انگلیسی: Microorganism) موجودات زنده‌ای هستند که با چشم غیر مسلح قابل مشاهده نیستند. این موجودات به دلیل اندازه کوچکشان به وسیله میکروسکوپ مشاهده می‌شوند. میکروارگانیسم‌ها نقش‌های مختلفی در طبیعت و زندگی روزمره دارند و به دسته‌های مختلفی تقسیم می‌شوند:
1. باکتری‌ها (Bacteria): این‌ها سلول‌های تک‌سلولی بدون هسته مشخص هستند. برخی از باکتری‌ها می‌توانند بیماری‌زا باشند، در حالی که بسیاری دیگر نقش‌های مفیدی مانند تجزیه مواد آلی و کمک به هضم غذا دارند.
2. ویروس‌ها (Viruses):